跳到正文

医学公开数据库查询与登记

使用有明确接口的公开数据库查询方法保存请求、筛选、分页与来源,可用于医学文献、临床试验及药物资料检索。

开源精选医疗业务86 个文件50,135 Stars浏览次数 0K-Dense-AI/scientific-agent-skills MIT版本 a1043ef
开始使用

下载前阅读 SKILL.md 中的使用条件,并确认所用工具支持对应能力。

输入资料
指定数据库和查询问题 实际接口、筛选条件及使用范围 阅读本节完整说明
交付内容
可复查的查询资料 请求、分页与来源记录 阅读本节完整说明
  1. 获取完整包,保留配套文件的目录结构。
  2. 按照原文准备所需工具、依赖与输入资料。
  3. 阅读对应使用步骤与输入输出说明,在自己的环境中验证结果。

使用提示摘自原文,配套文件保留来源版本;实际运行条件以各包说明为准。

正文

获取原文件

references/human-protein-atlas.md

Base URL

https://www.proteinatlas.org

Auth

No API key required.

Key Endpoints

Purpose URL Pattern
Gene data by Ensembl ID /{ENSEMBL_ID}.json
Search /search/{QUERY}; use the result page Download control for XML/TSV/JSON

Example Calls

# Gene data by Ensembl ID
https://www.proteinatlas.org/ENSG00000141510.json

# Search
https://www.proteinatlas.org/search/TP53

Response Format (JSON, gene endpoint)

{
  "Gene": "TP53",
  "Gene synonym": ["p53", "LFS1"],
  "Ensembl": "ENSG00000141510",
  "Gene description": "tumor protein p53",
  "Uniprot": ["P04637"],
  "Chromosome": "17",
  "Protein class": ["Transcription factors"],
  "RNA tissue specificity": "Low tissue specificity",
  "Subcellular location": ["Nucleoplasm"],
  "Pathology prognostics": [...]
}

Bulk Downloads

For large-scale work, use TSV files from https://www.proteinatlas.org/about/download:

  • normal_tissue.tsv — IHC tissue expression
  • rna_tissue_consensus.tsv — RNA consensus
  • subcellular_location.tsv
  • pathology.tsv — cancer prognostics

Rate Limits

No published limits. Be reasonable. Prefer bulk downloads for large queries.

CONTACT HAONAN

联系haonan

医疗 AI · 产品与独立开发

刘浩南

关注医疗 AI 从 demo 到真实落地,聚焦产品化、商业化与院内工作流效率提升。

12年医疗产研经验,大湾区头部医疗AI公司前产品总监,独立开发者

医疗 AI 产品化医疗 AI 商业化院内工作流效率
刘浩南的微信联系二维码
微信扫一扫,联系 haonan