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医学公开数据库查询与登记

使用有明确接口的公开数据库查询方法保存请求、筛选、分页与来源,可用于医学文献、临床试验及药物资料检索。

开源精选医疗业务86 个文件50,135 Stars浏览次数 0K-Dense-AI/scientific-agent-skills MIT版本 a1043ef
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  2. 按照原文准备所需工具、依赖与输入资料。
  3. 阅读对应使用步骤与输入输出说明,在自己的环境中验证结果。

使用提示摘自原文,配套文件保留来源版本;实际运行条件以各包说明为准。

正文

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references/emdb.md

Base URL

https://www.ebi.ac.uk/emdb/api/

Auth

No auth required.

Key Endpoints

Endpoint Description
/entry/{emdb_id} Full entry metadata (e.g. EMD-1234)
/entry/map/{emdb_id} Map/volume metadata
/entry/experiment/{emdb_id} Experimental details
/entry/fitted/{emdb_id} Fitted PDB models
/search/{query}?rows={n} Search entries by keyword

Example Calls

# Entry metadata
https://www.ebi.ac.uk/emdb/api/entry/EMD-1234

# Search for ribosome entries
https://www.ebi.ac.uk/emdb/api/search/ribosome?rows=5

# Experimental details
https://www.ebi.ac.uk/emdb/api/entry/experiment/EMD-1234

Response Format

JSON. Search accepts rows, page, and fl (field selection); inspect its returned search envelope and pagination before iterating. Entry metadata is an object with emdb_id, map, and experimental/sample sections, not the map density file itself.

Rate Limits

EBI fair-use policy. Map files (MRC/CCP4) available via FTP for bulk access.

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医疗 AI · 产品与独立开发

刘浩南

关注医疗 AI 从 demo 到真实落地,聚焦产品化、商业化与院内工作流效率提升。

12年医疗产研经验,大湾区头部医疗AI公司前产品总监,独立开发者

医疗 AI 产品化医疗 AI 商业化院内工作流效率
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